Distale Hypospadien bedürfen keiner weiteren Diagnostik. Präoperativ sollte ein Harnstatus und ggf. eine Ultraschalluntersuchung der Nieren und harnableitenden Harnwege gemacht werden. Proximale Hypospadien sollten immer einer erweiterten Diagnostik zugeführt werden. Dies sollte in einem Zentrum geschehen und interdisziplinär (Pädiater, Endokrinologe, Radiologe, Kinderurologe) angelegt sein. Es gilt dabei, alle möglichen Formen von Begleitfehlbildungen, Syndromen und Intersex auszuschließen.